בית מורשת יהדות בולגריה ישמר את נכסי התרבות, נכסי החומר, נכסי רוח, ההווי והסממנים של יהדות בולגריה באמצעות מוזיאון, ארכיון, אמצעי שמור עדכניים, וירטואלים ומחקר עכשווי.
בית מורשת יהדות בולגריה יהיה בית לקהילה היהודית הבולגרית ולצאצאיה, מקום מפגש ולימוד סיפורה של יהדות בולגריה לאורך מאות שנים ותחת האימפריה העות'מנית ולאחר העליות הגדולות עם קום המדינה.
בית מורשת יהדות בולגריה ביפו יקיים פעילות ונקודת מפגש בין עברה של הקהילה, אוצרות הרוח שלה וסיפור השואה הייחודי של הקהילה, לבין היצירה והקשר הבין דורי המתחדש ובארץ ישראל ובמדינת ישראל.
בית מורשת יהדות בולגריה יפעל לשיתוף פעולה, חיזוק וסיוע של מפעלות קהילת יהדות בולגריה לדורותיה בישראל ובגולה. לחזק ולסייע תוך שיתוף פעולה בכל גוף או פעולה המקדמת את המורשת הבולגרית.